Сталкиваюсь с такой проблемой постоянно.
Если тень от точечных источников, то можно сделать примерно так.
Рисовано левой пяткой, так что извиняйте, но смысл понятен. В области наложения теней от двух источников затемнение должно быть сильнее, пугаться этого не стоит - против законов физики не попрешь.
Но это очень схематичный пример (области теней заданы "на глаз" при помощи лассо с размытием границы селекции по гауссу, изменение плотности тени сымитировано простым линейным градиентом, результирующая плотность теней задана непрозрачностью слоев). По серьезному все делается несколько по другому.
Тень имеет довольно сложную структуру. Рядом с объектом она плотнее, причем изменение этой плотности нелинейно при удалении от объекта и зависит от его формы. На цвет тени оказывает влияние цвет фона и самого объекта, поэтому, в первом приближении можно использовать нейтрально-серые цвета в режиме наложения Multiply, но иногда тень приходится тонировать каким-либо оттенком.
В реальной работе я обычно использую следующий метод:
1. Не "играю" прозрачностью слоев, все слои ставлю в режим Multiply с непразрачностью 100%
2. Рисую тени нейтральным черным цветом с настройками инструмента Opasity 3-10%
3. На первом слое создаю самый грубый набросок тени (примерно то, что приведено на рисунке). Можно градиентом, можно большой кистью с мягкими краями.
4. На втором (и последующих) слоях кисточкой прорисовываю детали - зоны более плотного затемнения рядом с объектом.
5. Если требуется, изображения на последующих слоях подразмываю Гаусс блюром для большей плавности и мягкости.
6. Если требуется внести цветовой оттенок в тень делаю коррекцию на некоторых слоях при помощи кривых или на некоторых слоях рисую не нейтральным черным, а подтонированным (или комбинирую оба метода).
7. Когда основные построения закончены, выполняю тонкую подстройку затенения изменяя параметры непрозрачности отдельных слоев.
Как правило на одну тень приходится делать от 3 до 7 слоев, в зависимомти от сложности.
Задачу можно несколько упростить разделив проблемы создания формы тени и полутоновых переходов. Сначала создайте форму тени. Можно трансформировать объект целиком (если он достаточно плоский) или по частям (для данного кубика, например, сделать трансформ каждой грани, включая невидимые, и объеденить полученную проекцию фигуры на плоскость), и потом задать размывку границ полученной области. Можно строить путями, лассо или просто рисовать кисточкой. Когда форма тени готова, считайте ее как селекцию, сделайте Layer Group и накиньте на нее Layer Mask, используя данную селекцию. Все дальнейшие манипуляции со слоями для создания теней проводите внутри этой группы.