Sovlanik, вопрос у Вас такой
требующий однозначного ответа - что лучше?
Кто ж ответит... Кому что удобнее, то и лучше. Я попробовала и то, и то, лично мне "родная" Capture показалась удобнее, ею и пользуюсь. А товарищ мой, тоже с Никоном - тот пользуется Camera RAW, и говорит, что она лучше. Кому поверите - мне или ему?
Попробуйте, что Вам мешает.