Для загрузки по ФТП есть множество программ, бесплатных в том числе.
С автоматическим же сабмитом других программ нет, тем более бесплатных, потому что на поддержку такого софта тратится очень много времени и сил, из-за того, что стоки постоянно что-то меняют на сайтах.