Хм, так это не ошибка, а предупрждение о возможных проблемах. После него обычно запускается все, если нажать ок. Хотя, мб у вас и проявляются проблемы прям сразу, если после ОК программа не стартует.
Кроме того, в настройках можно отключить эту табличку. Например, новейший карабинер уже ничего не ломает (во всяком случае, на моей машине) - они починили, но мы по прежнему определяем и выдаем табличку.