Обвешивать да, но не изменять сам файл. В случае прекомпоза вы лезете внутрь и меняете содержимое. Естественно, меняется все, что этот прекомпоз потом использует. Вам надо менять не содержимео прекомпоза, а изменять его снаружи, обвешивать эффектами, как вы говорите.
Или вынесите текст и эффекты, которые хотите изменить за пределы прекомпоза и меняйте на здоровье.