Если после загрузки по FTP долгое время не появляются файлы, то я делаю так: загружаю их по HTTP, после этого опять захожу в FTP и удаляю всё оттуда, чтобы потом не появились дубликаты.
LevKr, поищите внимательно,
здесь есть ссылка "Delete selected files"