Эта комиссия вылезла в тот момент, когда вы вывели деньги не прямо на карту Visa, а на счёт, который привязан к карте. Хоть деньги в обоих случая и оказываются в итоге доступны на карте, но путь этих денег принципиально отличается, а с ним и поборы.
Если это еще не сделано, то добавьте в аккаунт Skrill свою долларовую карту именно как карту, а не счёт. Для добавления потребуется только та информация, которая написана на самой карте и предыдущие сообщения в этой ветке
Для успешного вывода без поборов у вас уже всё есть.