что-то похожее было с иллюстратором cs3. помогала только перезагрузка самой программы.
в вашем случае можно попробовать варианты:
1. можно попробовать принудительно назначить полосам прокрутки масштабирование для конкретно этих программ в "Wacom Tablet Properties".
2. если не помог первый пункт, то переустановить заново драйвер планшета.
з.ы. а какая версия продуктов?