Ну, как минимум ради удобства. Можно на 1 слой закинуть референс, на другом слое делать обводку поверх, на третьем - цвет, при этом не нужно выискивать нужную группу, чтоб скрыть её или заблокировать, а в конце, если нужен лишь один слой, то очень всё легко и быстро ищется и группируется.
А сколько примерно должно быть слоев и подслоев, вот в этом изображении? (для загрузки на шаттерсток)